Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NinlQ6ZQ12 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms