Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY7

Kdm3b, Lysine-specific demethylase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm3bQ6ZPY7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Kdm3bQ6ZPY7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm3bQ6ZPY7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms