Protein–RNA interactions for Protein: Q6X1Y6

Asic3, Acid-sensing ion channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic3Q6X1Y6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Asic3Q6X1Y6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Asic3Q6X1Y6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Asic3Q6X1Y6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Asic3Q6X1Y6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Asic3Q6X1Y6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Asic3Q6X1Y6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Asic3Q6X1Y6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Asic3Q6X1Y6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Asic3Q6X1Y6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Asic3Q6X1Y6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Asic3Q6X1Y6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Asic3Q6X1Y6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Asic3Q6X1Y6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Asic3Q6X1Y6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Asic3Q6X1Y6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Asic3Q6X1Y6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Asic3Q6X1Y6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Asic3Q6X1Y6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Asic3Q6X1Y6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Asic3Q6X1Y6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Asic3Q6X1Y6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Asic3Q6X1Y6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Asic3Q6X1Y6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Asic3Q6X1Y6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Asic3Q6X1Y6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Asic3Q6X1Y6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Asic3Q6X1Y6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Asic3Q6X1Y6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Asic3Q6X1Y6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms