Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl3Q6W5C0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl3Q6W5C0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms