Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc154Q6RUT8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms