Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms