Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE01

Snrnp40, U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein, mousemouse

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp40Q6PE01 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Snrnp40Q6PE01 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Snrnp40Q6PE01 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrnp40Q6PE01 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Snrnp40Q6PE01 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrnp40Q6PE01 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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