Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf1cQ6PDZ2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms