Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dtx4Q6PDK8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms