Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6PD19 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6PD19 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6PD19 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6PD19 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6PD19 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6PD19 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6PD19 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6PD19 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6PD19 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6PD19 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6PD19 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6PD19 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6PD19 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6PD19 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6PD19 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6PD19 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6PD19 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6PD19 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6PD19 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6PD19 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6PD19 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6PD19 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6PD19 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6PD19 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6PD19 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6PD19 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6PD19 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6PD19 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6PD19 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6PD19 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6PD19 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6PD19 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6PD19 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6PD19 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6PD19 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6PD19 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6PD19 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6PD19 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6PD19 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6PD19 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6PD19 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6PD19 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6PD19 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6PD19 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q6PD19 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q6PD19 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q6PD19 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q6PD19 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q6PD19 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q6PD19 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q6PD19 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q6PD19 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q6PD19 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q6PD19 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q6PD19 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q6PD19 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q6PD19 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6PD19 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6PD19 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6PD19 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6PD19 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6PD19 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6PD19 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6PD19 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6PD19 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6PD19 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6PD19 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6PD19 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6PD19 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6PD19 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6PD19 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6PD19 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6PD19 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6PD19 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6PD19 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6PD19 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6PD19 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6PD19 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6PD19 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6PD19 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q6PD19 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q6PD19 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q6PD19 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q6PD19 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q6PD19 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q6PD19 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q6PD19 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Q6PD19 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q6PD19 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q6PD19 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q6PD19 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q6PD19 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q6PD19 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q6PD19 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q6PD19 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q6PD19 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q6PD19 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q6PD19 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q6PD19 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms