Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms