Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zbtb40Q6PCS8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Zbtb40Q6PCS8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Zbtb40Q6PCS8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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