Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gapvd1Q6PAR5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gapvd1Q6PAR5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms