Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W0

Senp6, Sentrin-specific protease 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp6Q6P7W0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Senp6Q6P7W0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Senp6Q6P7W0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Senp6Q6P7W0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Senp6Q6P7W0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Senp6Q6P7W0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Senp6Q6P7W0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Senp6Q6P7W0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Senp6Q6P7W0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Senp6Q6P7W0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Senp6Q6P7W0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Senp6Q6P7W0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Senp6Q6P7W0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Senp6Q6P7W0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Senp6Q6P7W0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Senp6Q6P7W0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Senp6Q6P7W0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Senp6Q6P7W0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Senp6Q6P7W0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Senp6Q6P7W0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Senp6Q6P7W0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Senp6Q6P7W0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Senp6Q6P7W0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Senp6Q6P7W0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Senp6Q6P7W0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Senp6Q6P7W0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Senp6Q6P7W0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Senp6Q6P7W0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Senp6Q6P7W0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Senp6Q6P7W0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Senp6Q6P7W0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms