Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg2aQ6P4T0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms