Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdac10Q6P3E7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms