Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gpbp1l1Q6NZP2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpbp1l1Q6NZP2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms