Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms