Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Wdr44Q6NVE8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Wdr44Q6NVE8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms