Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Frem2Q6NVD0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frem2Q6NVD0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms