Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arhgap20Q6IFT4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms