Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KdsrQ6GV12 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KdsrQ6GV12 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KdsrQ6GV12 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KdsrQ6GV12 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KdsrQ6GV12 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KdsrQ6GV12 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KdsrQ6GV12 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KdsrQ6GV12 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KdsrQ6GV12 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KdsrQ6GV12 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KdsrQ6GV12 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KdsrQ6GV12 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KdsrQ6GV12 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KdsrQ6GV12 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KdsrQ6GV12 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KdsrQ6GV12 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KdsrQ6GV12 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KdsrQ6GV12 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KdsrQ6GV12 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KdsrQ6GV12 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KdsrQ6GV12 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KdsrQ6GV12 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KdsrQ6GV12 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KdsrQ6GV12 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KdsrQ6GV12 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KdsrQ6GV12 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KdsrQ6GV12 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KdsrQ6GV12 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KdsrQ6GV12 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KdsrQ6GV12 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KdsrQ6GV12 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KdsrQ6GV12 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KdsrQ6GV12 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KdsrQ6GV12 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KdsrQ6GV12 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KdsrQ6GV12 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KdsrQ6GV12 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KdsrQ6GV12 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KdsrQ6GV12 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KdsrQ6GV12 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KdsrQ6GV12 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KdsrQ6GV12 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KdsrQ6GV12 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms