Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Smarca2Q6DIC0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms