Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rftn1Q6A0D4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms