Protein–RNA interactions for Protein: Q6A065

Cep170, Centrosomal protein of 170 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170Q6A065 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cep170Q6A065 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cep170Q6A065 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cep170Q6A065 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cep170Q6A065 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cep170Q6A065 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cep170Q6A065 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cep170Q6A065 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cep170Q6A065 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cep170Q6A065 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cep170Q6A065 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cep170Q6A065 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cep170Q6A065 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cep170Q6A065 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cep170Q6A065 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cep170Q6A065 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cep170Q6A065 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cep170Q6A065 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cep170Q6A065 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cep170Q6A065 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cep170Q6A065 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cep170Q6A065 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cep170Q6A065 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cep170Q6A065 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cep170Q6A065 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cep170Q6A065 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cep170Q6A065 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cep170Q6A065 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cep170Q6A065 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cep170Q6A065 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cep170Q6A065 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cep170Q6A065 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cep170Q6A065 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cep170Q6A065 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cep170Q6A065 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cep170Q6A065 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cep170Q6A065 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms