Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZX8

Ablim3, Actin-binding LIM protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ablim3Q69ZX8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ablim3Q69ZX8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms