Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms