Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn4Q69Z26 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn4Q69Z26 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms