Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp4Q68FH0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp4Q68FH0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp4Q68FH0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp4Q68FH0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp4Q68FH0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp4Q68FH0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp4Q68FH0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp4Q68FH0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp4Q68FH0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp4Q68FH0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp4Q68FH0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp4Q68FH0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp4Q68FH0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp4Q68FH0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp4Q68FH0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp4Q68FH0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp4Q68FH0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp4Q68FH0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp4Q68FH0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp4Q68FH0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp4Q68FH0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp4Q68FH0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp4Q68FH0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp4Q68FH0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp4Q68FH0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp4Q68FH0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp4Q68FH0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp4Q68FH0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp4Q68FH0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkp4Q68FH0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp4Q68FH0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp4Q68FH0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp4Q68FH0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp4Q68FH0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp4Q68FH0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp4Q68FH0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp4Q68FH0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp4Q68FH0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp4Q68FH0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp4Q68FH0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkp4Q68FH0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp4Q68FH0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms