Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg9aQ68FE2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg9aQ68FE2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg9aQ68FE2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg9aQ68FE2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg9aQ68FE2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms