Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CltcQ68FD5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms