Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms