Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms