Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT5

Tpgs2, Tubulin polyglutamylase complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs2Q66JT5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpgs2Q66JT5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpgs2Q66JT5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpgs2Q66JT5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpgs2Q66JT5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpgs2Q66JT5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpgs2Q66JT5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpgs2Q66JT5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpgs2Q66JT5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpgs2Q66JT5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpgs2Q66JT5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpgs2Q66JT5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tpgs2Q66JT5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpgs2Q66JT5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms