Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc3Q64519 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc3Q64519 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc3Q64519 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc3Q64519 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc3Q64519 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc3Q64519 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc3Q64519 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc3Q64519 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc3Q64519 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc3Q64519 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc3Q64519 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc3Q64519 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc3Q64519 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc3Q64519 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc3Q64519 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc3Q64519 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc3Q64519 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc3Q64519 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc3Q64519 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc3Q64519 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc3Q64519 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc3Q64519 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc3Q64519 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc3Q64519 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc3Q64519 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc3Q64519 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc3Q64519 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc3Q64519 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc3Q64519 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc3Q64519 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc3Q64519 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc3Q64519 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc3Q64519 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms