Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Top2bQ64511 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms