Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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PtprdQ64487 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PtprdQ64487 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PtprdQ64487 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprdQ64487 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprdQ64487 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprdQ64487 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprdQ64487 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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PtprdQ64487 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprdQ64487 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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PtprdQ64487 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprdQ64487 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprdQ64487 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprdQ64487 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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PtprdQ64487 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprdQ64487 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprdQ64487 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PtprdQ64487 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprdQ64487 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprdQ64487 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprdQ64487 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprdQ64487 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprdQ64487 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PtprdQ64487 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprdQ64487 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprdQ64487 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprdQ64487 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprdQ64487 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprdQ64487 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PtprdQ64487 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprdQ64487 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprdQ64487 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprdQ64487 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprdQ64487 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprdQ64487 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprdQ64487 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprdQ64487 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprdQ64487 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprdQ64487 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprdQ64487 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprdQ64487 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprdQ64487 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprdQ64487 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprdQ64487 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprdQ64487 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprdQ64487 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprdQ64487 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprdQ64487 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprdQ64487 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms