Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf4Q64287 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms