Protein–RNA interactions for Protein: Q64124

Scx, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScxQ64124 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ScxQ64124 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ScxQ64124 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ScxQ64124 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ScxQ64124 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ScxQ64124 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ScxQ64124 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ScxQ64124 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ScxQ64124 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms