Protein–RNA interactions for Protein: Q64104

Nr2e1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e1Q64104 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr2e1Q64104 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr2e1Q64104 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr2e1Q64104 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr2e1Q64104 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr2e1Q64104 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr2e1Q64104 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr2e1Q64104 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr2e1Q64104 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr2e1Q64104 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr2e1Q64104 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr2e1Q64104 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr2e1Q64104 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr2e1Q64104 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr2e1Q64104 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr2e1Q64104 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr2e1Q64104 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr2e1Q64104 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr2e1Q64104 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms