Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pan3Q640Q5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pan3Q640Q5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms