Protein–RNA interactions for Protein: Q62457

Gm20917, (clone BALB8N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20917Q62457 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20917Q62457 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms