Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Hoxa13Q62424 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
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Hoxa13Q62424 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Hoxa13Q62424 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Hoxa13Q62424 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Hoxa13Q62424 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Hoxa13Q62424 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Hoxa13Q62424 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Hoxa13Q62424 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
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Hoxa13Q62424 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa13Q62424 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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