Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff3Q62395 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff3Q62395 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff3Q62395 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff3Q62395 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff3Q62395 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff3Q62395 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff3Q62395 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff3Q62395 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff3Q62395 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff3Q62395 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff3Q62395 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff3Q62395 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff3Q62395 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff3Q62395 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff3Q62395 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff3Q62395 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff3Q62395 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff3Q62395 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff3Q62395 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff3Q62395 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff3Q62395 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff3Q62395 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff3Q62395 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff3Q62395 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff3Q62395 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff3Q62395 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff3Q62395 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff3Q62395 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tff3Q62395 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tff3Q62395 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tff3Q62395 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tff3Q62395 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tff3Q62395 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tff3Q62395 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tff3Q62395 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tff3Q62395 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tff3Q62395 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tff3Q62395 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Tff3Q62395 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tff3Q62395 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Tff3Q62395 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tff3Q62395 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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