Protein–RNA interactions for Protein: Q62392

Phlda1, Pleckstrin homology-like domain family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phlda1Q62392 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phlda1Q62392 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phlda1Q62392 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phlda1Q62392 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phlda1Q62392 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phlda1Q62392 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phlda1Q62392 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phlda1Q62392 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phlda1Q62392 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phlda1Q62392 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phlda1Q62392 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phlda1Q62392 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phlda1Q62392 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phlda1Q62392 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phlda1Q62392 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phlda1Q62392 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phlda1Q62392 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phlda1Q62392 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phlda1Q62392 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Phlda1Q62392 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phlda1Q62392 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phlda1Q62392 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phlda1Q62392 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phlda1Q62392 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phlda1Q62392 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phlda1Q62392 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phlda1Q62392 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phlda1Q62392 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phlda1Q62392 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phlda1Q62392 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phlda1Q62392 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phlda1Q62392 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phlda1Q62392 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phlda1Q62392 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phlda1Q62392 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phlda1Q62392 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Phlda1Q62392 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phlda1Q62392 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms