Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ss18Q62280 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ss18Q62280 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ss18Q62280 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ss18Q62280 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ss18Q62280 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ss18Q62280 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ss18Q62280 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ss18Q62280 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ss18Q62280 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ss18Q62280 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ss18Q62280 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ss18Q62280 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ss18Q62280 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ss18Q62280 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ss18Q62280 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ss18Q62280 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ss18Q62280 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ss18Q62280 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ss18Q62280 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ss18Q62280 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ss18Q62280 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ss18Q62280 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ss18Q62280 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ss18Q62280 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ss18Q62280 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Ss18Q62280 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ss18Q62280 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms