Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SypQ62277 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SypQ62277 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SypQ62277 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SypQ62277 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SypQ62277 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SypQ62277 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SypQ62277 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SypQ62277 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SypQ62277 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SypQ62277 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SypQ62277 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SypQ62277 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SypQ62277 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SypQ62277 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SypQ62277 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SypQ62277 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SypQ62277 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SypQ62277 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SypQ62277 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SypQ62277 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SypQ62277 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SypQ62277 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SypQ62277 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SypQ62277 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SypQ62277 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SypQ62277 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SypQ62277 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SypQ62277 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SypQ62277 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SypQ62277 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SypQ62277 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SypQ62277 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SypQ62277 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SypQ62277 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SypQ62277 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SypQ62277 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SypQ62277 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SypQ62277 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SypQ62277 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SypQ62277 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SypQ62277 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SypQ62277 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SypQ62277 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SypQ62277 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SypQ62277 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SypQ62277 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SypQ62277 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SypQ62277 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SypQ62277 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SypQ62277 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SypQ62277 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SypQ62277 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SypQ62277 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SypQ62277 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SypQ62277 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SypQ62277 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SypQ62277 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SypQ62277 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SypQ62277 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SypQ62277 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SypQ62277 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SypQ62277 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SypQ62277 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SypQ62277 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SypQ62277 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SypQ62277 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SypQ62277 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SypQ62277 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SypQ62277 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SypQ62277 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SypQ62277 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SypQ62277 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SypQ62277 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SypQ62277 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SypQ62277 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SypQ62277 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SypQ62277 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SypQ62277 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SypQ62277 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SypQ62277 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SypQ62277 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SypQ62277 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SypQ62277 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SypQ62277 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SypQ62277 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SypQ62277 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SypQ62277 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SypQ62277 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SypQ62277 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SypQ62277 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SypQ62277 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SypQ62277 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SypQ62277 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SypQ62277 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SypQ62277 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SypQ62277 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SypQ62277 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SypQ62277 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SypQ62277 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms