Protein–RNA interactions for Protein: Q62270

Srms, Tyrosine-protein kinase Srms, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmsQ62270 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrmsQ62270 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms