Protein–RNA interactions for Protein: Q62266

Sprr1a, Cornifin-A, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1aQ62266 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms