Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Ttf1Q62187 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Ttf1Q62187 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ttf1Q62187 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ttf1Q62187 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ttf1Q62187 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ttf1Q62187 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ttf1Q62187 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Ttf1Q62187 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Ttf1Q62187 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Ttf1Q62187 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Ttf1Q62187 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Ttf1Q62187 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Ttf1Q62187 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Ttf1Q62187 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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